Já bych se toho taky nebál, viz citace z Wikipedie:
Elementární chlor se prakticky používá k desinfekci pitné vody, protože i v malých koncentracích hubí bakterie. Jeho nadbytek lze z vody snadno odstranit pouhým probubláním vzduchem.
Chlor z vody brzy vyprchá i pouhým odstátím, nechat vodu (např. v kbelíku) 10 minut před použitím odstát, je celkem běžná akvaristická praxe. A když to nevadí rybám...