Můžou být tyhle vnější filtry v provozu jen třeba 3 hodiny denně, nebo musí běžet nonstop?

Ano, musí běžet nonstop. Protože filtr funguje na tom principu, že krom mechanického odsátí a zachycení hrubých nečistot se v něm vytvoří aerobní bakterie, které rozkládají zbytky na méně škodlivé látky (které by v případě toho, že by tam byly rostliny posloužily jako hnojivo). Pokud se filtr vypne a přestane okysličovat, tak aerobní bakterie vyhynou a nahradí je anaerobní, které zbytky rozkládají na amoniak a další svinstva (v podstatě jedy). Které když se filtr opětovně zapne zamoří vodu. Takže filtr musí pořád běžet, aby to fungovalo jak má.